Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms