Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3b2Q9JME5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3b2Q9JME5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms