Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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