Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms