Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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