Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1cc1Q9ESK9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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