Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms