Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clstn1Q9EPL2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms