Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trmt112Q9DCG9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms