Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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