Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms