Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms