Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PudpQ9D5U5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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