Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms