Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms