Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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