Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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