Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms