Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Commd4Q9CQ02 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Commd4Q9CQ02 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Commd4Q9CQ02 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Commd4Q9CQ02 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Commd4Q9CQ02 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Commd4Q9CQ02 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Commd4Q9CQ02 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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