Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RtcbQ99LF4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms