Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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