Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms