Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms