Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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