Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Uhrf1Q8VDF2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Uhrf1Q8VDF2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Uhrf1Q8VDF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Uhrf1Q8VDF2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Uhrf1Q8VDF2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Uhrf1Q8VDF2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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