Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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