Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms