Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r200Q8R281 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Vmn1r200Q8R281 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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