Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hecw1Q8K4P8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms