Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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