Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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