Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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