Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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