Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4aQ8C9S8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Atg4aQ8C9S8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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