Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms