Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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