Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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