Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Prpf40bQ80W14 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf40bQ80W14 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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