Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms