Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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