Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sys1Q78S06 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms