Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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