Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms