Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctnna3Q65CL1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctnna3Q65CL1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctnna3Q65CL1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms