Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sdc3Q64519 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sdc3Q64519 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sdc3Q64519 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc3Q64519 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sdc3Q64519 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Sdc3Q64519 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sdc3Q64519 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc3Q64519 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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