Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sycp1Q62209 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sycp1Q62209 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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