Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sema3cQ62181 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema3cQ62181 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms