Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxd1Q61345 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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