Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms