Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbbp7Q60973 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms